Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPRAP18433 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRAP18433 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
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