Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOT1P17174 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOT1P17174 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOT1P17174 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOT1P17174 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOT1P17174 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOT1P17174 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOT1P17174 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOT1P17174 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOT1P17174 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOT1P17174 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOT1P17174 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOT1P17174 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOT1P17174 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOT1P17174 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOT1P17174 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOT1P17174 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOT1P17174 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOT1P17174 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOT1P17174 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOT1P17174 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOT1P17174 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOT1P17174 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOT1P17174 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOT1P17174 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GOT1P17174 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOT1P17174 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOT1P17174 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOT1P17174 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOT1P17174 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOT1P17174 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOT1P17174 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOT1P17174 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOT1P17174 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOT1P17174 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOT1P17174 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOT1P17174 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOT1P17174 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOT1P17174 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOT1P17174 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOT1P17174 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOT1P17174 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOT1P17174 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOT1P17174 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOT1P17174 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOT1P17174 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOT1P17174 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOT1P17174 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOT1P17174 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOT1P17174 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOT1P17174 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOT1P17174 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOT1P17174 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOT1P17174 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOT1P17174 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOT1P17174 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOT1P17174 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOT1P17174 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOT1P17174 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOT1P17174 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOT1P17174 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOT1P17174 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOT1P17174 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOT1P17174 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOT1P17174 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOT1P17174 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GOT1P17174 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOT1P17174 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOT1P17174 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GOT1P17174 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOT1P17174 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOT1P17174 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOT1P17174 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOT1P17174 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOT1P17174 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOT1P17174 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOT1P17174 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOT1P17174 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOT1P17174 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOT1P17174 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOT1P17174 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GOT1P17174 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOT1P17174 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOT1P17174 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOT1P17174 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOT1P17174 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOT1P17174 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOT1P17174 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOT1P17174 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOT1P17174 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOT1P17174 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOT1P17174 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOT1P17174 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOT1P17174 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOT1P17174 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GOT1P17174 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GOT1P17174 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GOT1P17174 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOT1P17174 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GOT1P17174 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms