Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2A2P16615 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms