Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EPCAMP16422 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EPCAMP16422 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EPCAMP16422 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EPCAMP16422 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EPCAMP16422 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EPCAMP16422 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EPCAMP16422 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EPCAMP16422 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EPCAMP16422 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EPCAMP16422 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
EPCAMP16422 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EPCAMP16422 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EPCAMP16422 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
EPCAMP16422 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
EPCAMP16422 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EPCAMP16422 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EPCAMP16422 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EPCAMP16422 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EPCAMP16422 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EPCAMP16422 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EPCAMP16422 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms