Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HOXD8P13378 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HOXD8P13378 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms