Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LAMC1P11047 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms