Protein–RNA interactions for Protein: P0DP23

CALM1, Calmodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM1P0DP23 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CALM1P0DP23 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CALM1P0DP23 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms