Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB1P08034 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB1P08034 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB1P08034 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB1P08034 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB1P08034 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB1P08034 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB1P08034 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB1P08034 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB1P08034 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB1P08034 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB1P08034 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB1P08034 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GJB1P08034 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GJB1P08034 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GJB1P08034 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB1P08034 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB1P08034 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB1P08034 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB1P08034 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB1P08034 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB1P08034 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB1P08034 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB1P08034 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB1P08034 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB1P08034 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB1P08034 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB1P08034 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB1P08034 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB1P08034 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB1P08034 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB1P08034 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GJB1P08034 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB1P08034 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB1P08034 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB1P08034 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB1P08034 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB1P08034 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB1P08034 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB1P08034 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB1P08034 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB1P08034 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB1P08034 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB1P08034 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB1P08034 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB1P08034 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB1P08034 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB1P08034 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB1P08034 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB1P08034 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB1P08034 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB1P08034 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB1P08034 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB1P08034 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GJB1P08034 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB1P08034 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB1P08034 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB1P08034 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB1P08034 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB1P08034 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB1P08034 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB1P08034 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB1P08034 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB1P08034 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB1P08034 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB1P08034 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB1P08034 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB1P08034 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB1P08034 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB1P08034 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB1P08034 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB1P08034 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB1P08034 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB1P08034 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB1P08034 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GJB1P08034 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB1P08034 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB1P08034 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB1P08034 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB1P08034 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB1P08034 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB1P08034 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB1P08034 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB1P08034 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB1P08034 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB1P08034 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB1P08034 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB1P08034 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB1P08034 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB1P08034 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB1P08034 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB1P08034 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB1P08034 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB1P08034 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB1P08034 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB1P08034 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB1P08034 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB1P08034 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB1P08034 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GJB1P08034 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms