Protein–RNA interactions for Protein: O95202

LETM1, Mitochondrial proton/calcium exchanger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM1O95202 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LETM1O95202 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM1O95202 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM1O95202 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM1O95202 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM1O95202 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM1O95202 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM1O95202 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM1O95202 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM1O95202 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM1O95202 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM1O95202 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM1O95202 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM1O95202 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM1O95202 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM1O95202 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM1O95202 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM1O95202 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM1O95202 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM1O95202 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM1O95202 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM1O95202 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM1O95202 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM1O95202 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM1O95202 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM1O95202 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM1O95202 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM1O95202 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM1O95202 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM1O95202 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM1O95202 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM1O95202 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM1O95202 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM1O95202 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LETM1O95202 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM1O95202 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM1O95202 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM1O95202 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM1O95202 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM1O95202 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM1O95202 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM1O95202 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM1O95202 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM1O95202 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM1O95202 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM1O95202 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM1O95202 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM1O95202 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM1O95202 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM1O95202 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM1O95202 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LETM1O95202 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LETM1O95202 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LETM1O95202 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LETM1O95202 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LETM1O95202 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LETM1O95202 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LETM1O95202 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LETM1O95202 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LETM1O95202 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LETM1O95202 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LETM1O95202 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LETM1O95202 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LETM1O95202 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LETM1O95202 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LETM1O95202 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LETM1O95202 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LETM1O95202 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LETM1O95202 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LETM1O95202 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LETM1O95202 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LETM1O95202 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LETM1O95202 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETM1O95202 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETM1O95202 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETM1O95202 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETM1O95202 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETM1O95202 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LETM1O95202 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETM1O95202 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETM1O95202 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETM1O95202 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETM1O95202 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETM1O95202 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETM1O95202 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETM1O95202 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETM1O95202 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETM1O95202 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LETM1O95202 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM1O95202 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM1O95202 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM1O95202 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM1O95202 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM1O95202 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM1O95202 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM1O95202 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM1O95202 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM1O95202 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM1O95202 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LETM1O95202 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms