Protein–RNA interactions for Protein: O95104

SCAF4, Splicing factor, arginine/serine-rich 15, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF4O95104 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SCAF4O95104 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAF4O95104 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAF4O95104 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAF4O95104 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAF4O95104 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAF4O95104 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAF4O95104 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAF4O95104 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAF4O95104 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAF4O95104 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAF4O95104 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAF4O95104 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAF4O95104 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAF4O95104 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAF4O95104 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAF4O95104 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAF4O95104 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAF4O95104 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAF4O95104 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAF4O95104 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAF4O95104 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAF4O95104 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAF4O95104 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAF4O95104 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAF4O95104 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAF4O95104 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAF4O95104 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAF4O95104 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAF4O95104 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAF4O95104 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAF4O95104 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SCAF4O95104 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms