Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP19O94966 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP19O94966 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP19O94966 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP19O94966 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP19O94966 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP19O94966 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP19O94966 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP19O94966 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP19O94966 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP19O94966 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP19O94966 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP19O94966 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP19O94966 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP19O94966 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP19O94966 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP19O94966 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
USP19O94966 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP19O94966 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP19O94966 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP19O94966 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP19O94966 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP19O94966 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP19O94966 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP19O94966 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP19O94966 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP19O94966 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP19O94966 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP19O94966 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP19O94966 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP19O94966 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP19O94966 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
USP19O94966 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP19O94966 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP19O94966 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP19O94966 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP19O94966 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP19O94966 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP19O94966 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP19O94966 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
USP19O94966 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP19O94966 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP19O94966 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP19O94966 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP19O94966 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP19O94966 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP19O94966 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP19O94966 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP19O94966 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP19O94966 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP19O94966 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP19O94966 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP19O94966 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP19O94966 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP19O94966 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP19O94966 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP19O94966 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP19O94966 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP19O94966 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP19O94966 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP19O94966 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP19O94966 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP19O94966 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP19O94966 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP19O94966 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP19O94966 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP19O94966 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP19O94966 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP19O94966 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP19O94966 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP19O94966 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP19O94966 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP19O94966 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP19O94966 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
USP19O94966 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP19O94966 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP19O94966 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP19O94966 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP19O94966 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP19O94966 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP19O94966 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP19O94966 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP19O94966 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP19O94966 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP19O94966 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP19O94966 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP19O94966 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP19O94966 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP19O94966 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP19O94966 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP19O94966 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP19O94966 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP19O94966 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
USP19O94966 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
USP19O94966 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
USP19O94966 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
USP19O94966 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
USP19O94966 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
USP19O94966 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
USP19O94966 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms