Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGSF3O75054 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF3O75054 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms