Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNSO60931 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNSO60931 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNSO60931 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNSO60931 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNSO60931 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNSO60931 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNSO60931 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNSO60931 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNSO60931 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNSO60931 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNSO60931 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNSO60931 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNSO60931 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNSO60931 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNSO60931 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNSO60931 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNSO60931 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNSO60931 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNSO60931 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNSO60931 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTNSO60931 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNSO60931 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNSO60931 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNSO60931 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNSO60931 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNSO60931 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNSO60931 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNSO60931 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNSO60931 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNSO60931 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNSO60931 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNSO60931 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNSO60931 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNSO60931 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNSO60931 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNSO60931 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNSO60931 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNSO60931 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNSO60931 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNSO60931 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNSO60931 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNSO60931 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTNSO60931 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNSO60931 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNSO60931 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNSO60931 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNSO60931 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNSO60931 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNSO60931 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNSO60931 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNSO60931 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNSO60931 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNSO60931 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNSO60931 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNSO60931 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNSO60931 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNSO60931 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNSO60931 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNSO60931 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNSO60931 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNSO60931 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNSO60931 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNSO60931 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNSO60931 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNSO60931 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNSO60931 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNSO60931 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNSO60931 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNSO60931 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNSO60931 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNSO60931 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNSO60931 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNSO60931 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNSO60931 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNSO60931 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNSO60931 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNSO60931 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNSO60931 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNSO60931 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNSO60931 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNSO60931 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNSO60931 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNSO60931 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNSO60931 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNSO60931 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNSO60931 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNSO60931 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNSO60931 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNSO60931 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNSO60931 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNSO60931 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNSO60931 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNSO60931 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNSO60931 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNSO60931 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNSO60931 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNSO60931 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNSO60931 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNSO60931 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms