Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAK2O60296 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAK2O60296 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms