Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTRA2O43464 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTRA2O43464 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTRA2O43464 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTRA2O43464 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTRA2O43464 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTRA2O43464 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HTRA2O43464 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HTRA2O43464 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HTRA2O43464 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HTRA2O43464 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HTRA2O43464 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HTRA2O43464 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms