Protein–RNA interactions for Protein: O14787

TNPO2, Transportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 897 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO2O14787 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNPO2O14787 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms