Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRTO14522 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRTO14522 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
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