Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PIK3CDO00329 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms