Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LINC01387J3KSC0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms