Protein–RNA interactions for Protein: A8MUK1

USP17L5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L5A8MUK1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L5A8MUK1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP17L5A8MUK1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms