Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SOBPA7XYQ1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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