Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RGPD3A6NKT7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RGPD3A6NKT7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms