Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC160A6NGH7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms