Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VWA3AA6NCI4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VWA3AA6NCI4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms