Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VWA8A3KMH1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms