Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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CAPN6Q9Y6Q1 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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CAPN6Q9Y6Q1 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CAPN6Q9Y6Q1 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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