Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
USP35Q9P2H5 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms