Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC6□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
LRRC9Q6ZRR7 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRC9Q6ZRR7 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRC9Q6ZRR7 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRC9Q6ZRR7 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRC9Q6ZRR7 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRC9Q6ZRR7 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRC9Q6ZRR7 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRC9Q6ZRR7 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRC9Q6ZRR7 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRC9Q6ZRR7 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRC9Q6ZRR7 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms