Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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SGCAQ16586 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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SGCAQ16586 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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SGCAQ16586 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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SGCAQ16586 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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SGCAQ16586 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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SGCAQ16586 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
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SGCAQ16586 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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SGCAQ16586 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SGCAQ16586 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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