Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
BRD3Q15059 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms