Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms