Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
PTCH1Q13635 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
PTCH1Q13635 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms