Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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SP140Q13342 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SP140Q13342 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SP140Q13342 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SP140Q13342 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SP140Q13342 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SP140Q13342 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SP140Q13342 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SP140Q13342 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SP140Q13342 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SP140Q13342 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SP140Q13342 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SP140Q13342 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SP140Q13342 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SP140Q13342 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SP140Q13342 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SP140Q13342 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SP140Q13342 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SP140Q13342 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SP140Q13342 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SP140Q13342 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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