Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AL359094.1-211ENST00000608350 335 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 GCNT2-202ENST00000316170 4381 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 CFLAR-201ENST00000309955 14672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 MEPE-208ENST00000540395 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 SGK1-223ENST00000528577 1850 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 PDE1A-201ENST00000351439 2338 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 ERVFRD-1-202ENST00000542862 3184 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 CCP110-202ENST00000396208 5151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 OR4F17-203ENST00000618231 2586 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 TRPM8-201ENST00000324695 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 MYO1B-203ENST00000392316 4764 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 RNA5SP472-201ENST00000363868 119 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 RN7SKP207-201ENST00000411204 303 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 PTP4A1-206ENST00000627002 447 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 HEPH-203ENST00000419594 3694 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 TRPM3-208ENST00000377105 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 CASR-205ENST00000639785 10047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 ZFX-204ENST00000379188 7513 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 NNT-201ENST00000264663 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 MAPK10-377ENST00000642006 2752 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 PVALB-201ENST00000216200 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 USPL1-201ENST00000255304 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 ENPP5-202ENST00000371383 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 RN7SKP91-201ENST00000410852 288 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC138035.1-201ENST00000499986 992 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 IGLV1-62-201ENST00000518003 441 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 RN7SL667P-201ENST00000582817 298 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.57-201ENST00000597717 283 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 EFCAB8-204ENST00000618684 435 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 ZNF438-208ENST00000538351 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 STK33-201ENST00000315204 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
MKRN3Q13064 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.8 ms