Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 TRPS1-209ENST00000519674 3116 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 APP-209ENST00000440126 2846 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 SLC24A1-211ENST00000544319 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 CASP10-206ENST00000374650 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 SNORA81.1-201ENST00000458922 177 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AC060809.1-201ENST00000559211 564 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 OR4X2-201ENST00000624868 1025 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 FTO-222ENST00000637969 2889 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 MYOF-202ENST00000359263 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 PCM1-212ENST00000519253 6443 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 DNAJC5G-203ENST00000404433 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 LAX1-203ENST00000442561 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 USP13-203ENST00000496897 2747 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 GPX6-201ENST00000361902 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 CORIN-202ENST00000502252 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 CACNB2-201ENST00000282343 3524 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 ZNF407-207ENST00000582337 5662 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 GABRA1-202ENST00000393943 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 NSD2-224ENST00000514045 3964 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 ASPH-230ENST00000541428 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AC009108.3-201ENST00000602739 3515 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 ZNF649-201ENST00000354957 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 YME1L1-201ENST00000326799 3994 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 NUP98-202ENST00000355260 5628 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 HMGB4-204ENST00000522796 2505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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FOXC1Q12948 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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FOXC1Q12948 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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FOXC1Q12948 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 IGLVI-42-201ENST00000522485 381 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
FOXC1Q12948 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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