Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
PPARDQ03181 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms