Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SSFA2P28290 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms