Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AC233728.1-201ENST00000418049 218 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 MPPED2-201ENST00000358117 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 SIRPG-AS1-202ENST00000456177 2795 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 GRPR-201ENST00000380289 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 FANCL-201ENST00000233741 1683 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AC018992.1-201ENST00000523778 2149 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 BEST1-202ENST00000449131 4267 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 GAPVD1-207ENST00000394105 5207 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AL355974.1-201ENST00000618896 1708 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 VWC2L-IT1-201ENST00000416430 467 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 SCG5-207ENST00000497208 949 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 RN7SL199P-201ENST00000578752 281 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 RN7SL656P-201ENST00000579044 281 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 RN7SL404P-201ENST00000582421 281 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
HOXA2O43364 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms