Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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SH3BP4Q9P0V3 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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SH3BP4Q9P0V3 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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SH3BP4Q9P0V3 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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SH3BP4Q9P0V3 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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SH3BP4Q9P0V3 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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SH3BP4Q9P0V3 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
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SH3BP4Q9P0V3 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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SH3BP4Q9P0V3 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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SH3BP4Q9P0V3 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SH3BP4Q9P0V3 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
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