Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTXN3Q4LDR2 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms