Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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RAB39AQ14964 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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RAB39AQ14964 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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RAB39AQ14964 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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RAB39AQ14964 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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RAB39AQ14964 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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RAB39AQ14964 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RAB39AQ14964 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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