Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MT1L-202ENST00000566367 78 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 MIR5705-201ENST00000579870 89 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 RPL23AP77-201ENST00000588044 463 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 RN7SL82P-201ENST00000611435 237 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 RN7SL628P-201ENST00000619139 237 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 PCBP1-AS1-322ENST00000628147 553 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 GJA1-201ENST00000282561 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 CD86-201ENST00000264468 2634 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 CYP8B1-201ENST00000316161 3974 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 ADGRB3-202ENST00000370598 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 NFASC-204ENST00000401399 10205 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 TCF4-203ENST00000398339 2551 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 POTEH-AS1-201ENST00000422014 2566 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 KCNA2-205ENST00000633222 11877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 MYO6-208ENST00000627432 4074 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 ABCA17P-204ENST00000494925 3478 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 CDY1-201ENST00000306609 2321 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 CDY1B-201ENST00000306882 2321 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 LAX1-202ENST00000367217 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 EHF-201ENST00000257831 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 SPTAN1-223ENST00000630866 7498 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 ZNF670-ZNF695-202ENST00000474541 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC107419.1-201ENST00000422048 1879 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 NPEPPS-215ENST00000530173 2864 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 ESRP1-202ENST00000423620 3746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC104958.1-201ENST00000509350 1973 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 PHLPP2-206ENST00000568954 8317 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 NEDD4L-204ENST00000382850 8251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 GART-201ENST00000361093 2149 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 RN7SKP50-201ENST00000364694 315 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 TCEAL4P1-201ENST00000453620 588 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AL157400.2-201ENST00000454174 563 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 RN7SL740P-201ENST00000467060 344 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC127024.1-201ENST00000490847 418 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 RAB30-205ENST00000527633 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 MRPL40P1-201ENST00000542687 604 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 PIWIL2-204ENST00000521356 3488 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 LY75-CD302-201ENST00000504764 5650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 B3GALT5-202ENST00000380618 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 TMED8-201ENST00000216468 7784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 OR2A20P-201ENST00000479887 2913 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC091940.1-204ENST00000507318 3091 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 TMEM99-204ENST00000622451 2073 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 SCN8A-203ENST00000545061 11433 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC016831.3-201ENST00000446451 1723 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 EIF4E3-204ENST00000425534 9949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 OPALIN-203ENST00000393871 3545 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 PARP1P1-201ENST00000413631 3026 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AKT3-203ENST00000366539 5127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 DOCK8-205ENST00000453981 7237 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 NAA11-201ENST00000286794 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC016582.1-202ENST00000636341 2982 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 RASGEF1B-203ENST00000436139 6323 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 NOS1-202ENST00000338101 4462 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 CLASP2-213ENST00000480013 5972 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AL031123.2-201ENST00000563225 3325 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 LINC01721-201ENST00000457274 2376 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AL109811.1-201ENST00000452378 2682 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 ATP5J2-201ENST00000292475 607 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 LINC00851-201ENST00000423033 727 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC005040.1-201ENST00000437783 482 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 CR391992.1-201ENST00000438601 394 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 HIST1H2APS6-201ENST00000448609 364 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
MKRN4PQ13434 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms