Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
GPS1Q13098 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
GPS1Q13098 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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