Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
FOXD4Q12950 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.2 ms