Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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USP18Q9UMW8 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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USP18Q9UMW8 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
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USP18Q9UMW8 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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USP18Q9UMW8 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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USP18Q9UMW8 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP18Q9UMW8 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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