Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
RNF17Q9BXT8 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RNF17Q9BXT8 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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