Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CBFBQ13951 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms