Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CACNA1SQ13698 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CACNA1SQ13698 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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