Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
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CDH18Q13634 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
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CDH18Q13634 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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CDH18Q13634 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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CDH18Q13634 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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CDH18Q13634 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
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