Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TRAF1Q13077 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms